Обучение
Какие навыки вы получите в процессе обучения?
- Научитесь планировать, организовывать и проводить исследования с использованием самых современных методов и технологий в области молекулярной биологии, генетики и биоинформатики.
- Сможете самостоятельно обрабатывать и анализировать полученные экспериментальные "омиксные" данные: геномы, транскриптомы, протеомы и их совокупности в широком спектре биологических, медико-биологических и иных приложений.
- Научитесь работать с базами данных разной направленности и структуры как с помощью готовых программных пакетов, так и путем самостоятельного написания кода.
Лекционные курсы
1 семестр
сентябрь - январь
2 семестр
февраль - май
3 семестр
сентябрь - январь
1 семестр
| Спецкурсы | ||
| Программирование на Python | Дмитрий Дмитриевич Пензар | Экзамен |
| Биостатистика | Филичкина Елена Михайловна, Сопленкова Анна Глебовна | Экзамен |
| Генетика человека | проф. Нефедова Лидия Николаевна | Экзамен |
| Научно-исследовательский семинар | к.б.н. Левицкий Сергей Алексеевич | Зачет |
| Анализ данных высокоэффективного секвенирования | к.б.н. Чеканов Николай Николаевич | Экзамен |
| Academic writing for Genomics | к.ф.н. Шарапкова Анастасия Андреевна | Финальная защита проекта (статьи) на английском |
| Потоковые курсы | ||
| Философия | к.ф.н. Жульева Нина Викторовна | Зачет |
| Биоэтика | проф. Бушев Станислав Адександрович | Зачет |
| Иностанный язык | Зачет |
2 семестр
| Спецкурсы | ||
| Биоинформатика | проф. Миронов Андрей Александрович | Экзамен (+ БРС) |
| Введение в протеомику | к.б.н. Клычников Олег Игоревич | Экзамен |
| Геномика человека | к.б.н. Тяжелова Татьяна Владимировна | Экзамен |
| Анализ данных омиксных технологий | к.б.н. Герасимов Евгений Сергеевич | Экзамен |
| Academic communication for Genomics | к.ф.н. Шарапкова Анастасия Андреевна | Экзамен |
| Потоковые курсы | ||
| Философия | к.ф.н. Жульева Нина Викторовна | Зачет |
| Иностанный язык |
3 семестр
| Спецкурсы | ||
| Геномика одиночных клеток | к.б.н. Фишман Вениамин Семенович | Экзамен |
| Статические основы шума экспрессии генов | к.б.н. Мошкин Юрий Михайлович | Экзамен |
| Анализ экспрессии генов на уровне трансляции: от биохимии к системной биологии | к.б.н. Дмитриев Сергей Евгеньевич | Экзамен |
| Функциональная геномика и здоровье человека | к.б.н. Скоблов Михаил Юрьевич | Зачет |
Практические курсы
-
Практикум по нанопоровому секвенированиюSkyGen — это команда профессионалов, которая поставила перед собой цель сделать доступными реагенты, оборудование и сервис для российских научных лабораторий.
-
Практикум по секвенированию на приборах BGI/MGIBSI Group — крупнейшая в мире организация по исследованию геномов, предоставляющая услуги в области геномики, такие как генетические данные, секвенирование и прикладные решения в области генных технологий.
-
Практикум по секвенированию на приборах IlluminaКомпания ООО Альбиоген является эксклюзивным официальным торговым представителем и дистрибьютором компании Illumina на территории Российской Федерации.
Научно-исследовательская работа
- Тема работы должна быть связана с геномикой и здоровьем человека
- На выполнение дипломных работ учебным планом предусмотрен 4 семестр
- Для выбора места выполнения дипломной работы проводятся экскурсии и ротации в различных лабораториях
- Выбор темы и курирование дипломных работ проводится специалистами программы
Партнерские лаборатории
Рекомендованные лаборатории, в которых студенты программы успешно выполнили дипломные работы.
| Организация | Лаборатория | Тема дипломной работы |
|---|---|---|
| МГМУ имени И.М. Сеченова | Лаборатория трансляционной геномной биоинформатики. Лаборатория клинической геномной биоинформатики | Исследование геномной нестабильности опухолей с применением РНК-секвенирования |
| ФГАНУ ФНЦИРИП им. М. П. Чумакова РАН | Отдел актуальных и вновь возникающих инфекций с пандемическим потенциалом | Генетическая изменчивость SARS-COV-2 при пассивировании в культуре клеток in vitro Генетическая изменчивость SARS-CoV-2 в процессе циркуляции в человеческой популяции |
| Сколковский институт науки и технологий | Khrameeva Laboratory | Изменение архитектуры хроматина при шизофрении |
| Laboratory of Metagenome Analysis | ||
| ФГБУ «НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова» | Лаборатория биоинформатического анализа геномных данных | Сравнительный анализ программ по поиску мутаций de novo |
| ФГБУ НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева Минздрава России | Лаборатория трансплантационной иммунологии и иммунотерапии гемобластозов | Анализ клональной структуры Т-клеточного репертуара после аллогенной трансплантации гемопоэтических клеток у пациентов детского возраста |
| Лаборатория цитогенетики и молекулярной генетики | Сравнительная оценка эффективности алгоритмов анализа данных секвенирования РНК после поиска химерных транскриптов в детской онкологии | |
| ИППИ РАН имени А.А. Харкевича | Лаборатория молекулярной эволюции | Характеристика наследственной изменчивости в популяциях с различной эффективной численностью |
| НИЦ «Курчатовский институт» | Лаборатории молекулярной генетики человека | Анализ возможной функциональной связи генов LOXHD1 и AGBL1 с дистрофией роговицы Фукаса |
| Лаборатория геномики прокариот | ||
| ИБХ РАН | Лаборатория химии протеолитических ферментов | |
| Лаборатория биокатализа | ||
| Группа геномного анализа сигнальных систем клетки | ||
| НИЦЭМ Гамалеи | Лаборатория механизмов популяционной изменчивости патогенных микроорганизмов | |
| Институт Общей Генетики им. Н. И. Вавилова РАН | Лаборатория эволюционной геномики | |
| ФИЦ Фунд. основы биотехнологии РАН | Лаборатория геномики и эпигеномики позвоночных |